Lunn, a mí me pasó eso muy al principio del desarrollo del PolarFIS, cuando estaba de betatester. El problema venía porque uno de los componentes de la PolarFIS se recalentaba y se reseteaba.
Sin embargo, en posteriores desarrollos se corrigió este problema y no se había vuelto a oír al respecto.
Lo mejor que puedes hacer es ponerte en contacto con la gente de Auto-polar para que vean ellos directamente el por qué de ese comportamiento.