Hola, no veo que problema tienes con las válvulas "salidas" en el primer caso el árbol de levas está montado y por eso hay válvulas abiertas, en el segundo está sin él por eso están todas cerradas.
Hay que ver esas válvulas y asientos para ver si necesitan rectificado o si simplemente llega con un buen esmerilado.
Y las guías de válvula? las han comprobado?
No olvides poner retenes nuevos a las guías.
Ahora lo he visto, en el taller de rectificado deberían saber si podían rebajar o no, no te han dado una junta de sobremedida?
Saludos.