Joer qué cosa más rara..
Normalmente, el Tempomat se desactiva por un problema en el sensor de embrague/freno, pero al llevar DSG sería en el sensor del freno únicamente. También puede ser un mal contacto en la maneta del Tempomat, que esta no registra avería, y detecta un problema, y no reacciona hasta parar el motor y arrancar de nuevo (reset).
Podrías empezar por comprobar con el Vag-Com el interruptor de freno, y los botones de la maneta del Tempomat, y hacer lo mismo cuando falle (sin retirar la llave del contacto) para ver si cazas el problema. No veo por ahora otra solución.