Parece que tienes obstruído el radiador de calefacción(yo lo cambié en Diciembre).
Hay que desmontar el salpicadero entero(entre montaje y desmontaje VW estima 8,5h de trabajo). El radiador(un Hella en mi caso) unos 170€ creo recordar.
En mi caso fue por un tapafugas que el anterior propietario echó y fue lo que lo obstruyó. Anular la refrigeración de la EGR, desmontar/montar salpciadero y reemplazar el radiador, líquido refrigerante nuevo G12, limpieza del circuito entero con un producto de Auxol y tres aclarados= 1012€ + IVA.
Eso sí, ahora calienta de maravilla todo el coche.
Un saludo y suerte
P.D: Estimación de diagnóstico en base a lo que has escrito.