Antes de cambiar un módulo confort, se debe de comprobar que es compatible con el coche, no sólo hay que fijarse que tenga 4 conectores compañero. Hay muchas referencias y terminaciones, y no todas valen para todos los coches. Este es el principal error que cometes.

Con 'casar' el módulo confort, me refiero a adaptarlo al coche con el Vag-Com, no vale con cambiarlo por otro y listo, hace falta decirle al coche el módulo de confort que vas a instalar, y los extras que quieres llevar activos. Tu segundo error es no guardar un simple AutoScan.

No me a quedado claro, si al poner tu antiguo módulo confort, sigues teniendo el mismo problema, o los problemas desaparecen. Has probado a hacerlo?? yo de temas de referencias y compatibilidades entre ellas, no puedo ayudarte, ese tema no lo domino.