Bueno lo he conseguido solucionar a medias
Ya no me sale ese mensaje, simplemente desconectando el antivirus de windows se ha solucionado.
Pero despues de usar una sola vez el vagcom, a la segunda vez ya no me funciona, pincho en cualquiera de los modulos, pero no entra en ninguno.
Simplemente no se pueden seleccionar.
Igual ha petado el cable?