Aparentemente la junta es de goma con lo que no necesitas echar pasta de silicona para que cierre bien. Aun asi si le quieres echar un poco (por si estan las tapas de aluminio algo retorcidas) tampoco pasa nada. Eso si, antes de encender el coche espera a que se endurezca la silicona.
Lo mas importante a la hora de meter una junta nueva es darle a los tornillos el par de apriete adecuado ¿porque? porque si te pasas apretando esparramas la goma toda y al final estaras igual que ahora, con fugas.
Suerte.