Lo que tienes que hacer es andar con cuidado, y sí cambias algún valor apuntar el valor antiguo y el nuevo, así siempre a podrás revertir los cambios.
Sobretodo cómo ya digo, cuidado, el VAG-COM es una gran herramienta, pero puede ser desastroso sí no se usa con un mínimo de cuidado y conocimientos (que podrás adquirir a poco que leas este u otros foros)