A eso se le denomina (descebe de circuito) entra aire en algún punto, y cuando intentas arrancar, lo hace mal hasta que el sistema se ceba y arranca. Cuando arranca, si lo arrancas después arranca bien, porque el circuito está cebado y no a entrado demasiado aire. Pero tras 12 horas o más, si da tiempo y vuelven los problemas.

Cuánto tiempo tiene el filtro de combustible? empezaría por aquí.

Cambiando el filtro de combustible + juntas (y probar). También puede ser descebe por la bomba tándem, juntas tóricas de inyectores, aforador (etc..) con un manómetro saldrías de dudas rápido, y observando si por al rededor de la bomba tándem hay fuga de combustible o por algún manguito (etc..) que pueda indicar que hay fuga y entrada de aire.