Todo depende de tu presupuesto, tus gustos, y lo que andes buscando en realidad. Lo primero que hay que dejar claro (y es evidente) que Audi es Audi, y que a pesar de que últimamente se comparte entre todas las plataformas las misma piezas (etc..) la calidad difiere.
No difiere tanto, como hace años, que el salto de calidad de piezas era muy notable, pero se sigue notando claramente, dónde estás sentado. Yo me siento en mi Golf, y me siento en el Audi A4 1.9 TDI 130 AVF del mismo año, y pufff se nota la diferencia bastante.
A favor del Passat, es el motor transversal, que se trabaja mejor en él, y no tienes que quitar el morro para realizar muchas operaciones. En el Audi, es motor longitudinal, y claro, dificulta trabajar en él, y evidente, las piezas y averías, salen más caras que en el Passat.
Yo te emplazo a que pruebes ambos, mires los extras de cada uno, el confort de marcha, sonidos, sensaciones (etc..) y compres el que más te complazca.