Los motores Common Rail no han dado problemas en general siempre y cuando no sean EA189 (EURO V), que son los famosos del diesel gate. No es que estos den problemas de por sí, pero hay dos situaciones: 1) que haya pasado la campaña de gases, lo cual puede causar en algunos motores problemas (sobre todo con la EGR) o 2) que no la haya pasado pero que en algún momento se convierta en oligatorio como ya lo es en Alemania o Austria y te conviertas en el caso 1.

Por lo demás, el único defecto conocido en los common rail, que yo sepa, es que la EGR puede ser un poco frágil y dependiendo del motor muy cara de cambiar (hay modelos en los que se sitúa detrás del motor al lado del turbo y hay que desmontar bastante para cambiarla y modelos en los que está en posición frontal y su cambio es sencillo).

Yo no compraría a estas alturas algo que no fuera Common Rail. Los 2.0 anteriores te pueden salir muy buenos y hay muchos ejemplos (yo mismo tuve uno), pero si te toca la china suelen pecar de problemas graves, especialmente los primeros en salir al mercado. Pero vamos, si buscas modelos del 2010 en adelante casi todos serán common rail.