Aunque te hubieras quedado sin gasoil (yo no llevaría el coche nunca tan bajo de gasoil), ese motor debería arrancar sin problemas en cuanto tuviera gasoil otra vez porque el circuito se purga solo, no como en los más modernos Common Rail. Además ya has comprobado que hay gasoil en el filtro, lo cual descarta casi seguro que sea la bomba del depósito o el filtro se habría vaciado. Sigo apostando por rotura de inyector, pero necesitas hacer un diagnóstico para eso. El problema es que si es eso no podrás achacárselo al vendedor porque no es un fallo crónico que te haya ocultado: en estos motores, el coche funciona perfectamente hasta que sin previo aviso, como te pasó a ti, deja de funcionar. No hay manera de predecir el fallo por el comportamiento del coche.
Y no es barato. Estamos hablando de 600 euros como poco.