Leí navegando que el teléfono entraba en modo protección para no pasar del amperio cuando había problemas para mantener la supercarga (falsos contactos del conector USB, cable, etc.) con esto se protege para que no salga ardiendo. Para salir de ese modo recomendaban llevar a valores de fábrica o similares (el hecho de haber cambiado la batería podría dejar ese modo guardado en alguna ROM y no sería suficiente con un apagado total del móvil). Prueba con eso y si no se soluciona (con todo lo que has cambiado) habría que pensar en la placa base (circuito de carga). Saludos