Eto lo explicó Moncho hace unos años. La razón es que hay partes del motor (en algunos motores) que están cebadas siempre con el motor en marcha. Al apagarlo, lentamente ese aceite va bajando al cárter, y si miras el nivel en los primeros 5 minutos, tienes una medida más exacta del aceite que debería haber en el cárter (más parecido a la distribución de aceite con el motor en marcha) que si esperas a que estas partes se descebe y todo el aceite acabe en el cárter. Lo que ocurre es que en condiciones normales, si llevas el nivel cerca del máximo, la diferencia no es suficiente para causar ningún problema. Eso sí, imagínate que lo miras en frío y está justo en el mínimo. En realidad estás por debajo del mínimo porque no estás teniendo en cuenta las instrucciones del fabricante.
Lo que ocurre es que normalmente nadie deja que el aceite baje tanto.