Es una cosa bastante extraña, incluso podria ser defecto del software de la centralita ya que a mi me pasaba una cosa similar pero con los elevalunas.
Los configure para que cerraran con un toque y no funcionaba, asi que lo deje asi hasta que un dia fui a la vw por un problema con los espejos y actualizaron el software de los modulos de las 4 puertas y a partir de ese dia y con la misma codificacion, funciona el cierre de ventanillas con un toque.
Esto ya lo he visto en mas passats de la misma fecha, por lo que en tu caso puede ser igual, que saliera una remesa de centralitas capadas o con un software que no permitia eso...
Salu2